Kanser: 4 gen ini membantu meramalkan hasilnya
Penyelidikan yang mendalam mengenai peranan penekan tumor p53 menawarkan pemahaman yang lebih besar mengenai mutasi genetik yang berlaku dalam pelbagai bentuk barah, serta mengenal pasti empat gen yang dapat membantu meramalkan pandangan seseorang.
The TP53 gen bertanggungjawab untuk mengekodkan apa yang para saintis sebut protein tumor p53 - penekan tumor yang dapat menghentikan sel daripada membahagi dan berkembang biak terlalu cepat.
Penyelidik telah menjuluki TP53 "penjaga genom" kerana peranannya yang sangat penting dalam mencegah tumor dan menjaga pembahagian sel.
Kanser pada manusia sering berlaku mutasi pada TP53 gen, menyebabkan salah satu mekanisme pertahanan kritikal terhadap barah gagal.
Kajian pertama yang mengenal pasti TP53 mutasi pada barah manusia muncul pada tahun 1980-an dan, sejak itu, para penyelidik telah meluangkan banyak masa dan sumber untuk menjelaskan peranannya dalam barah.
Kini, kajian terbesar seumpamanya menggunakan sampel tumor dari lebih 10,000 pesakit barah dan melihat 32 jenis barah untuk memahami peranan TP53.
Larry Donehower, seorang profesor virologi molekul dan mikrobiologi di Baylor College of Medicine di Houston, TX, memimpin penyelidikan baru, yang muncul dalam jurnal Laporan Sel.
Gen Telltale 4 dapat membantu meramalkan pandangan
Donehower dan pasukan menggunakan lima platform data yang berbeza untuk mengekstrak 10,225 sampel dari 32 kanser. Dengan menggunakan The Cancer Genome Atlas (TCGA), para penyelidik dapat menilai secara komprehensif peranan jalur p53 dalam 32 kanser ini.
Donehower dan rakan sekerja kemudian membandingkan data TCGA dengan pangkalan data lain dengan 80,000 mutasi genetik yang telah dihimpunkan oleh Dr. Thierry Soussi - seorang profesor biologi molekul di Universiti Sorbonne di Paris, Perancis dalam jangka masa 30 tahun.
Para penyelidik mendapati bahawa TP53 mutasi berlaku lebih kerap pada orang yang mempunyai pandangan yang lebih buruk. Selanjutnya, analisis mendapati bahawa "Lebih daripada 91% kanser dengan TP53 mutasi menunjukkan kehilangan kedua-duanya berfungsi TP53 alel, ”atau varian gen.
Dr. Donehower menjelaskan: "Dalam beberapa gen barah, anda akan melihat satu salinan dari dua gen yang hilang atau bermutasi," tetapi "lebih dari 91 peratus daripada semua kanser kehilangan kedua-duanya TP53 gen, bukan hanya satu. "
Kehilangan alel kedua, tulis penulis, berlaku oleh "mutasi, penghapusan kromosom, atau kehilangan heterozigositas netral" - iaitu, pendua gen. Penyelidik utama juga menyatakan bahawa proses terakhir ini berlaku lebih kerap daripada yang mereka percayai sebelumnya.
Yang penting, penyelidikan itu juga mengenal pasti empat gen yang menunjukkan ekspresi berlebihan dalam mutan TP53 ketumbuhan. Menurut para penyelidik, keempat-empat gen ini dapat "memberitahu" apakah pesakit barah mempunyai pandangan yang baik atau tidak.
"Sekiranya anda mempunyai ekspresi tinggi keempat-empat gen tersebut, anda mempunyai pesakit yang lebih cenderung mengalami prognosis yang buruk [...] Sebaliknya, jika pesakit itu mempunyai ekspresi gen yang sangat rendah, dia mungkin akan bertahan lebih lama dan mempunyai prognosis yang baik. "
Larry Donehower Dr.
"Ini akan memberi anda gambaran yang lebih baik tentang bagaimana dia bernasib daripada hanya mengetahui apakah dia mutan TP53 atau tidak, ”sambung Dr. Donehower.
Akhirnya, kajian ini sangat berkaitan TP53 mutasi dengan ketidakstabilan genom, penemuan yang sesuai dengan TP53Peranan khas sebagai "penjaga genom."
Dr. Donehower mengulas mengenai keunikan penyelidikan baru itu, dengan mengatakan, "Sebilangan besar kajian mengenai TP53 fokus pada satu jenis barah. "
"Melihat 32 jenis barah yang berlainan, anda melihat bahawa corak tertentu bertahan tanpa mengira jenis barah."
Pengarang bersama dan pengarah Genomik Kanser di Baylor College of Medicine, Dr David Wheeler, juga mengulas mengenai kepentingan penemuan tersebut.
Dia berkata: "Sejak TP53 adalah salah satu penjaga pintu yang paling penting dalam pencegahan barah, semakin baik kita memahami gen ini, semakin baik kita dapat memahami asas biologi kanser. Itu akan membawa kepada terapi yang lebih baik. "
