Kanser prostat: Data besar membuka 80 sasaran ubat baru
Dalam kajian terbesar untuk menganalisis genetik kanser prostat, saintis mendapati tidak kurang dari 80 sasaran ubat berpotensi baru. Projek ini membuka jalan yang luas untuk reka bentuk rawatan baru.
Mengekstrak data genetik, suatu ketika dahulu, adalah tugas yang membebankan dan sangat memakan masa.
Namun, ketika teknologi terus meningkat, pekerjaan menjadi lebih cepat dan lebih murah.
Secara selari, alat yang tersedia untuk menangani set data yang besar telah bertambah baik.
Secara keseluruhan, ini berarti bahwa lautan maklumat yang diambil dari kod genetik dapat dianalisis, dipetakan, dan digabungkan dengan kemudahan relatif untuk memberikan tingkat kejelasan baru.
Baru-baru ini, pasukan antarabangsa menggunakan pendekatan analisis serampang dua mata dan data besar ini untuk mengetahui genetik kanser prostat. Mengenai pencarian molekul molekul di perisai penyakit ini, penyelidikan itu disusun oleh Institute of Cancer Research di London, United Kingdom.
Cabaran barah prostat
Kanser prostat adalah barah kedua yang paling biasa di kalangan lelaki di Amerika Syarikat. Tahun ini, di A.S., dianggarkan terdapat 164.690 kes barah prostat baru dan hampir 30,000 kematian akibat penyakit ini.
Walaupun para penyelidik telah membuat kemajuan dalam memahami dan merawat barah prostat, masih ada sejumlah kesulitan.
Sebagai pemimpin kajian Prof Rosalind Eeles menjelaskan, "Salah satu tantangan yang kita hadapi dalam penyelidikan kanser adalah kerumitan penyakit dan sebilangan besar cara kita berpotensi mengatasinya."
Dr. Justine Alford, dari Cancer Research UK, menggariskan satu lagi masalah dalam mengkaji dan campur tangan dalam kanser prostat.
"Rintangan utama untuk membuat kemajuan lebih lanjut terhadap kanker prostat," dia menjelaskan, "adalah kurangnya cara untuk meramalkan secara tepat bagaimana penyakit seseorang akan berkembang, menjadikannya sukar untuk mengetahui rawatan mana yang terbaik untuk setiap pasien."
Menuai data genetik
Untuk mendekati masalah dari arah baru, para penyelidik mengambil maklumat genetik dari 112 lelaki dengan barah prostat dan menggabungkannya dengan data dari pelbagai kajian lain. Secara keseluruhan, sampel dari 930 pesakit digunakan.
Dengan menggunakan teknik data besar terbaru, tim mengumpulkan wawasan baru mengenai perubahan genetik yang memicu perkembangan dan mendorong kemajuan kanser prostat. Setelah mereka mengetahui gen mana yang terlibat, mereka dapat membuat peta protein yang dikodkan oleh gen ini.
Selanjutnya, mereka beralih ke pangkalan data yang disebut canSAR, yang menggabungkan data dari kajian, menerapkan pembelajaran mesin, dan membantu memberikan wawasan mengenai penemuan ubat.
Di laman web mereka, dapatSAR menjelaskan pertanyaan yang ingin dijawab oleh pangkalan data mereka: “Apa yang diketahui mengenai protein, di mana kanker dinyatakan atau bermutasi, dan alat kimia dan model garis sel apa yang dapat digunakan untuk menguji aktivitinya secara eksperimen? Apa yang diketahui mengenai ubat, profil kepekaan selularnya, dan protein apa yang diketahui mengikat yang dapat menjelaskan bioaktiviti yang tidak biasa? "
Para saintis mendapati bahawa 80 protein yang telah mereka temui adalah sasaran ubat yang berpotensi. Dan, 11 daripadanya disasarkan oleh ubat-ubatan yang ada, dan tujuh yang lain boleh menjadi sasaran ubat-ubatan yang sudah dalam ujian klinikal.
Penemuan mereka diterbitkan minggu ini dalam jurnal Genetik Alam.
"Kajian kami menerapkan teknik canggih dalam analisis data besar untuk membuka banyak maklumat baru mengenai barah prostat dan kemungkinan cara untuk memerangi penyakit ini."
Prof Rosalind Eeles
Melihat ke masa depan
Penemuan ini memerlukan kajian lebih lanjut sebelum mereka dapat digunakan secara klinikal, tentu saja, tetapi mereka menyediakan pelbagai kemungkinan baru.
Seperti yang dijelaskan oleh pengarang bersama Prof Paul Workman, “Kajian ini telah menemukan sejumlah besar gen baru yang mendorong perkembangan barah prostat, dan memberi kita maklumat penting tentang bagaimana memanfaatkan biologi penyakit untuk mencari potensi perawatan baru. "
Dia berharap karya mereka akan "merangsang gelombang penelitian baru mengenai perubahan genetik dan potensi sasaran obat [yang] mereka kenal pasti, dengan tujuan agar pesakit mendapat manfaat secepat mungkin."
Halangan lain untuk reka bentuk rawatan barah prostat adalah cara penyakit ini berkembang secara berbeza pada setiap individu. Ini menjadikannya lebih sukar untuk menentukan pilihan rawatan mana yang paling sesuai untuk setiap pesakit.
Dr. Alford berharap bahawa "[b] dapat meningkatkan pemahaman kita tentang genetik di sebalik penyakit ini, [...] di masa depan, pengetahuan ini dapat membantu para doktor untuk menyesuaikan rawatan dengan barah seseorang dengan lebih baik, dan diharapkan dapat melihat lebih banyak orang terselamat dari penyakit mereka. "
Ini adalah hari-hari awal, tetapi penemuan yang akan datang dari kajian generasi akan datang dapat berubah ke lapangan.
